Modules

  • Améliorer l'utilisation de l'eau et des nutriments grâce à un système racinaire plus efficient

    Cereal root systems ©Ird
    La révolution verte s'est basée sur l'utilisation massive d'intrants et sur la sélection des plantes pour ces conditions. Le coût économique et l'impact environnemental de ces intrants, ainsi que leur disponibilité limitée impose un changement de paradigme. Ce module illustrera comment une meilleure connaissance du fonctionnement du système racinaire, de la nutrition hydrominérale et des techniques de phénotypage racinaire permettent d'envisager la sélection de plantes possédant des systèmes racinaires plus efficients

  • “Omiques” comparatives de plantes tropicales

    “Omiques” comparatives de plantes tropicales
    Les technologies NGS ont conduit à une impressionnante production de données « Omiques » pour les plantes cultivées tropicales telles que le riz, le sorgho, la canne à sucre, le bananier, les palmiers, les agrumes, le cacaoyer, le caféier, le cotonnier. Ceci permet de réaliser des études d’«Omiques» comparatives à une échelle sans précédent, et permet également de s'attaquer aux problèmes difficiles tels que le séquençage et l'analyse de génomes complexes.

  • Plantes et Hommes, une histoire partagée

    Les étudiants lors d'une enquête de terrain avec un producteur d'oignons © A Seye
    Ce module vise à faire prendre conscience aux étudiants qu'étudier les plantes cultivées, c'est s'intéresser non seulement à l'objet biologique mais aussi à l'environnement tant physique et climatique, que social et culturel.

  • Amélioration des fruits et légumes à l'ère du haut débit

    Fruit de melon sauvage © J David
    Le module amélioration des fruits et légumes à l'ère du haut débit offre, sur un groupe d'espèces particulier, une vision globale sur les objectifs et les approches modernes d'analyse génétique, ainsi qu'un aperçu sur les ressources génétiques, leur organisation, leur conservation et leur utilisation.

  • New Crops - Conception des cultures et des plantes de demain

    Cultiver le riz en conditions limitantes: un enjeu pour demain © IRRI
    Les évolutions de l'agriculture (changements environnementaux et sociétaux) suggèrent un changement de paradigme de l'amélioration des plantes et de la protection des cultures. Il est proposé aux étudiants (niveau M1) d'imaginer les variétés de demain, les nouvelles stratégies de protection et leur mise en œuvre dans les systèmes de production. Ce module jettera les bases pour des enseignements dans les sciences du végétal appliquées aux agro-systèmes en mobilisant les connaissances acquises par les étudiants dans un contexte multidisciplinaire.

  • Les 3000 génomes du riz, une introduction à la diversité génétique

    Diversité du riz
    La diversité génétique est la base de l'amélioration des plantes. Cette diversité au niveau de la séquence du génome lui même devient de plus en plus accessible et cela va révolutionner la recherche en bilogie. Parmi les grandes cultures, le riz est un bon choix pour relever les défis qui en découlent et de nouvelles opportunités s'ouvrent.

  • Analyser et modéliser les phénotypes des plantes pour des environnements difficiles

    Pommier simulé à l'aide du modèle MappleT
    L'amélioration des plantes pour l'adaptation à des environnements difficiles est un enjeu crucial dans le contexte actuel des changements climatiques. Les caractères et les allèles liées à l'adaptation à des environnements difficiles sont complexes (combinaison de caractères), difficiles à définir et sont différents en fonction des environnements cibles. Les techniques de phénotypage au champ ou en conditions contrôlées permettant d'aborder ces questions demandent à être davantage développées. La combinaison de la modélisation génétique et écophysiologique peut aider à résoudre ces difficultés et aidera la conception d'idéotypes adaptés.

  • Amélioration des plantes tropicales et méditerranéennes : diversité des enjeux et des stratégies

    Etudes de cas (cotonnier, sorgho, canne à sucre, vigne, agrumes, riz et bananier)
    L'agriculture doit répondre à des grands enjeux globaux et sociétaux (alimentation et développement humain, changement climatique, agro-écologie et durabilité des systèmes, ressources génétiques et agrobiodiversité, ...). Dans ce contexte, la création de variétés améliorées (cultivars) représente une solution possible à la fois simple et accessible aux producteurs et aux utilisateurs. Dans le même temps l'activité de l'amélioration des plantes a connu des avancées importantes, passant d'une approche empirique à des stratégies plus élaborées, utilisant par exemple les marqueurs moléculaires ainsi que les données massives issues de la génomique, ou encore s'appuyant sur un phénotypage fin permettant la définition d'idéotypes.

  • Epigénome et amélioration végétale

    Fruits de palmiers à huile de type 'normal' (gauche) et variant 'mantled' (droite) © Alain Rival/Cirad
    La diversité intra-espèce, vue comme la seule variation dans la séquence d'ADN, a longtemps été considérée comme le moteur du fonctionnement d’individus ou de populations. Cependant, les différences au sein de l'espèce, et donc potentiellement la biodiversité fonctionnelle, peuvent également être créées par une variation épigénétique. Il devient donc important de quantifier la diversité naturelle épigénétique, en testant ses conséquences phénotypiques.

  • Edition du génome pour l’agriculture: aspects légaux, politiques et institutionnels

    DNA licence Creative Commons
    Les outils d'édition du génome permettent un accès direct, moins coûteux que par le passé et plus rapide aux génomes des plantes. Il s'agit d'une révolution technologique avec des implications sur le long terme. Ces outils changent les pratiques d'usage et de partage des ressources biologiques végétales, y compris les pratiques d'amélioration des plantes. Ces technologies suscitent un ensemble de questions autour des aspects institutionnels, légaux et politiques.

  • PAMPA : Phénotypage AnatoMique des Plantes pour leur Amélioration

    Un des microscopes que les étudiants pourront utiliser pendant le module PAMPA. © C. Baptiste
    Ce module de formation permet aux étudiants de prendre conscience de l'importance des caractères anatomiques pour la sélection végétale, et d’acquérir des compétences méthodologiques nouvelles. Ils découvrent et participent à la mise en œuvre d’une méthode de phénotypage anatomique ultra-rapide mise au point par les chercheurs de l'unité AGAP, tout en participant à un véritable projet de recherche scientifique sur une plante d’intérêt agronomique.

  • Photosynthèse et efficience d'utilisation de l'eau dans un cadre de changement climatique

    Appareil de mesure de photosynthèse de feuille © D Fabre
    Dans un contexte de changement climatique, l'augmentation des concentrations atmosphériques de dioxyde de carbone (CO2), des températures ou la raréfaction des précipitations affectent les processus physiologiques fondamentaux de la plante et peuvent altérer la croissance des plantes et les rendements agronomiques.

  • Gestion durable des stress biotiques en amélioration variétale

    Riz en Afrique de l'Ouest, vers une résistance durable contre la bactériose
    Les stress biotiques causés par les virus, les champignons, les bactéries, les insectes et autres agents pathogènes constituent une contrainte majeure à la productivité agricole. L'utilisation de génotypes résistants est le moyen le plus économique et le plus écologique de lutter contre les maladies des plantes.

  • Sélection participative: impliquer pleinement les agriculteurs dans le processus de développement des variétés

    Vidéo sélection participative Madagascar
    La question de la sélection participative occupe une place de plus en plus importante au sein de la recherche agronomique.
    Elle appelle sciences biologiques et sciences humaines à collaborer pour construire un nouveau champ de recherche.