L'unité de Génétique et d'Amélioration des Fruits et Légumes est composée de 5 équipes de recherche

• L'équipe Diversité, Qualité et Environnement chez la tomate (Qualitom) utilise la génétique quantitative et les outils de la génomique, tels que la transcriptomique, afin d'étudier la diversité génétique et les déterminants génétiques et phénotypiques de la qualité du fruit chez la tomate cultivée, Solanum lycopersicum'.
• L'équipe Génétique Intégrative et Innovation chez lez Prunus (G2IP) s’intéresse aux productions fruitières à noyau méditerranéennes majeures que sont l’abricotier (Prunus armeniaca), le pêcher (Prunus persica) et leurs porte-greffes. Elle déploie ses activités de la recherche fondamentale jusqu’à la création de nouvelles variétés en partenariat avec le secteur privé afin de participer à la conception des vergers de demain.
• L'équipe Résistances aux Virus (Rev) s’intéresse à la caractérisation des bases génétiques et moléculaires de la Résistance des plantes aux virus, à partir de l’étude des facteurs de la plante nécessaires au cycle viral. Notre objectif est d'acquérir des connaissances et des outils pour promouvoir la lutte génétique contre les bio-agresseurs.
• L'équipe Résistances et Reproduction chez le Melon (Melo)  caractérise la diversité fonctionnelle des gènes d’intérêt agronomique et construit de nouveaux systèmes génétiques chez le melon. Elle étudie la diversité et l’évolution du système de reproduction et la diversité et la durabilité des résistances aux pucerons et aux oïdiums.
• L'équipe Résistances Durables chez les Solanacées (RDS) mène des recherches sur la résistance aux virus, oomycètes et nématodes pathogènes sur des légumes appartenant à la famille des solanacées.