AGAP, Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et tropicales

La très grande unité de recherche AGAP, créée le 1er janvier 2011, est une unité mixte de recherche placée sous la tutelle de trois organismes de recherche et d’enseignement supérieur réunis autour de l'amélioration génétique des plantes tropicales et méditerranéennes : le Cirad, l'Inra et Montpellier SupAgro

L'unité œuvre en faveur de la création de matériel végétal le mieux adapté aux systèmes de productions concernant les 20 principales espèces végétales tropicales et méditerranéennes.

Les équipes de recherche de l'unité AGAP impliquées dans le projet CultiVar sont :

  • Développement Adaptatif du Riz (DAR). L’objectif de l’équipe vise à comprendre les bases cellulaires et moléculaires du développement du système racinaire chez le riz.
  • Diversité, adaptation et amélioration de la vigne (DAAV). Les recherches sur la vigne se décomposent en trois axes :- l'étude de la diversité et de l'évolution de la vigne et des espèces apparentées ; - l'identification des bases génétiques et moléculaires des caractères d'intérêt et de l'adaptation ; et - l'intégration de ces informations pour la prédiction des caractères et l'innovation variétale
  • Biologie cellUlaire de la Réponse aux STress abiotiques et biotiques chez les espèces pérennes (BURST). L’équipe a pour objectif de participer à l’amélioration de la tolérance aux stress abiotiques chez les espèces pérennes. La compréhension des processus physiologiques et de développement liés à la réponse aux stress est abordée par des approches intégratives afin de développer des marqueurs fonctionnels et des méthodologies de phénotypage.
  • Architecture et fonctionnement des espèces fruitières  (AFEF). L’objectif de l’équipe est d’explorer les bases éco-physiologiques et les déterminismes génétiques du développement végétatif et reproducteur du pommier et de l’olivier, dans un contexte de changement climatique.
  • Dynamiques de la diversité, sociétés et environnements (DDSE). L'équipe organise ses recherches sur trois axes complémentaires : l'analyse rétrospective des dynamiques qui ont conduit à la diversité, l'étude des dynamiques actuelles de cette diversité, et l'approche prospective
  • Génétique et innovation variétale (GIV). L’objectif de l’équipe est le perfectionner l’ingénierie de la création-diffusion variétale de l’eucalyptus, du riz et du sorgho.
  • Integration des données (ID). Les travaux portent sur des recherches méthodologiques et algorithmiques dans le domaine de l’analyse bioinformatique des séquences génomiques végétales. Ces recherches concernent notamment la génomique comparative (analyse de la synténie, prédiction des gènes orthologues, l’évolution des rétrotransposons), et la diversité génétique (analyses des haplotypes, phylogéographie, diversité des gènes d’intérêt).
  • Plasticité phénotypique et adaptation des monocotylédones (PAM).Les objectifs de l’équipe sont de quantifier et d’analyser la plasticité et la diversité des caractères d’intérêt agronomique, et de formaliser et modéliser le fonctionnement intégré du peuplement dans son environnement local.
  • Structure et évolution des génomes (SEG). L'objectif de l'équipe est de mieux comprendre la structure et l’organisation de génomes complexes en particulier polyploïdes, tels que la canne à sucre et le bananier.
  • Structure Évolutive des Agrumes, Polyploïdie et Amélioration Génétique (SEAPAG). Les objectifs de l’équipe portent sur l’acquisition et l’intégration des connaissances dans les domaines de la biologie de la reproduction, de la physiologie de l'adaptation aux stress abiotiques, de la résistance aux maladies et de l'élaboration de la qualité des agrumes.
  • Modèles et méthodes pour le phénotypage des plantes (M2P2). Le but de l’équipe est de développer des méthodes et composants logiciels pour gérer et analyser les données de phénotypage de plantes.
  • Plateforme d'histologie et d'imagerie cellulaire végétale (PHIV). L’objectif général est le développement par l’innovation, des techniques de visualisation in situ et in vivo des principales molécules du vivant.