Analyser et modéliser les phénotypes des plantes pour des environnements difficiles

L'amélioration des plantes pour l'adaptation à des environnements difficiles est un enjeu crucial dans le contexte actuel des changements climatiques. Les caractères et les allèles liées à l'adaptation à des environnements difficiles sont complexes (combinaison de caractères), difficiles à définir et sont différents en fonction des environnements cibles. Les techniques de phénotypage au champ ou en conditions contrôlées permettant d'aborder ces questions demandent à être davantage développées. La combinaison de la modélisation génétique et écophysiologique peut aider à résoudre ces difficultés et aidera la conception d'idéotypes adaptés.
Expérimentation (cotonniers) sur la plateforme de phénotypage PhenoArch /INRA © JM Lacape

En formant des étudiants à ces domaines de recherche, on augmentera les qualifications des futurs agronomes/écophysiologistes en mesure d'apporter de nouvelles compétences aux programmes/entreprises de sélection et de phénotypage. A notre connaissance, au moins 10-20 scientifiques avec ce type de profil ont été recrutés par les entreprises du secteur semencier dans les 3 dernières années, et la demande est croissante. Les porteurs de ce module ont une expertise dans le domaine et ils disposent d'installations modernes pour le phénotypage et la modélisation des plantes. Ils sont impliqués dans de grands projets visant à la conception des plantes (annuelles, prérennes) de demain face à des environnements difficiles (sous climats tempérés et tropicaux). L'accès à ces installations et aux recherches en cours dans le cadre de ces projets sont au cœur du module.

Objectifs du module

  • Apporter aux étudiants des connaissances sur les techniques récentes de phénotypage, et développer leur capacité d'analyse sur ces outils
  • Expliquer et illustrer comment la combinaison du phénotypage et de la modélisation peut aider (i) la dissection des interactions GxE x Management (GxExM) sur la base d'une description des processus élémentaires et des caractères à la base de la performance de la culture, (ii) l'analyse du rôle de la variabilité génétique par la combinaison in silico des caractères/processus élémentaires et en conséquence, (iii) à la prédiction de la performance sous diverses conditions environnementales

 Résultats attendus de la formation

  • Modélisation écophysiologique pour la dissection des interactions G X E X M: développer les compétences en modélisation écophysiologique comme complément du phénotypage
  • Méthodes de phénotypage: analyses de la potentialité, des limites technologiques et de la signification des caractères mesurés

Organisation et prochaine session

Les cours sont organisés sous la forme d'une école thématique (ouverte aux chercheurs).

Le module (1 semaine, 30 hrs) est enseigné en anglais. Il est organisé par les unités LEPSE (équipe MAGE), Boris Parent, Francois Tardieu et Claude Welcker, et AGAP (équipes PAM et AFEF), Delphine Luquet et Benoit Pallas.

Il se tient à Montpellier.

Téléchargez le Programme de la session 2019 (en anglais).